自动化液体处理
在新一代测序文库制备中的应用

新一代测序(NGS),也称大规模平行测序,因其灵活性、稳健性和高通量特性,促进了测序技术在生物学研究中的广泛应用。典型的NGS工作流程包含四个关键步骤:样本制备、文库制备、测序以及数据分析。

文库制备是将核酸转化为可供测序的格式的关键过程,为获得可靠的测序数据奠定基础。该过程包括DNA片段化、接头连接、PCR扩增、纯化、定量和标准化。若需在单次测序运行中处理多个样本,则需对单个文库进行索引标记并合并。为确保数据完整性,这一多步骤流程要求精确的液体处理和对细节的高度关注。因此,在选择液体处理方案时,需综合考虑移液体积精度、方案复杂性、反应微型化程度、处理时间以及通量水平等因素。

NGS workflow

典型新一代测序(NGS)工作流程的通用步骤。对于RNA样本,在文库制备前,样本制备可能包含一个额外的cDNA合成步骤。

采用手动液体处理进行文库制备时,效率低、劳动强度大,且受限于较低的通量。此外,使用手持移液器难以实现反应体系的微型化,且易于出错,导致结果不一致。通过自动化NGS文库制备,可有效应对这些挑战:它能提供精确且稳定的分液,以执行复杂的操作方案(尤其适用于小体积),并通过微型化降低处理成本。

Formulatrix 自动化液体处理助力NGS文库制备

Formulatrix 自动化液体处理(ALH)可为微型化反应提供精确的低体积液体转移,同时节省时间和成本。我们的产品组合包括非接触式液体分液器(如 Mantis® 和 Tempest®)以及液体处理器(如 F.A.S.T.TMFLO i8® PD ),旨在通过高通量提升文库制备效率。

 

Formulatrix的无吸头液体分液器Mantis和Tempest采用专利微流控技术,可实现亚微升级体积的高精度分液。F.A.S.T.(流动轴向密封吸头)是一款96通道正置换液体处理器,提供0.1至13 µL的体积范围。Flo i8是一款气置换液体处理器,配备8个独立跨度通道,非常适合更大体积的液体转移。其通道集成了流速传感器,可实现实时液体类型优化。

 

这一系列ALH技术不仅能确保即使是难处理试剂也能实现精确且可重复的分液,还能通过文库制备的微型化减少试剂消耗,降低总体成本。

 

阅读案例研究,了解如何通过四分之一反应体积获得高质量测序数据

 

Formulatrix ALH系统兼容CSV格式文件,可简化样本合并、标准化和系列稀释等复杂且劳动密集型的任务。此外,应用程序接口(API)支持与任何实验室设置无缝集成,实现完全自动化。

Mantis - Liquid Dispenser
Tempest - Liquid Dispensing
F.A.S.T. - Liquid Handler
Flo i8- Automated Liquid Handling

Mantis

Tempest

F.A.S.T.

FLO i8 PD

精度

在100 nL时<2%

在200 nL时<5%

在100 nL时<5%

在1 µL时<5%

微型化

分液体积低至100 nL

分液体积低至200 nL

移液体积低至100 nL

移液体积低至500 nL

通量

支持至1536孔板,最多48种试剂

支持至1536孔板,24板堆叠容量,最多12种试剂,96个喷嘴

支持最高384孔板,96通道移液头,6块置板区域

支持最高384孔板,8个独立通道,10块置板区域

直观的用户界面功能

CSV导入、回填、浓度标准化

CSV导入、连续稀释、挑取列表、合并、广播式分液、微孔板标记和浓度标准化

Formulatrix自动化液体处理系统解决了构建精确且具成本效益的NGS文库的挑战。

ngs table mobile LH
"Formulatrix 的 F.A.S.T.系统在我们构建长读长单细胞LIS-seq文库中至关重要。它使我们能够高效地进行微升级单细胞cDNA的板间移液。此外,该仪器让我们能在极短时间内将来自四块独立板的384个独特索引引物合并到我们的cDNA板上,有效降低了蒸发风险。"
Koen Deserranno
博士研究员

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This webinar demonstrates how to optimize single-cell RNA-seq workflows with the Mantis liquid dispenser, providing methods to correct 3' bias and enhance experimental accuracy.

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Publications
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